楠梓校區（原高海科大校本部） 背景與遷移： 隨著高雄海專的發展，旗津校區腹地受限。學校於是在楠梓區（鄰近後勁溪與捷運紅線）取得新校地。 1997年： 學校升格為「國立高雄海洋技術學院」，楠梓校區逐漸成為行政與教學中心。 2004年： 升格為「國立高雄海洋科技大學」。 校區定位： 楠梓校區作為原海科大的校本部，設施完善。合併為高科大後，這裡主要涵蓋海洋工程、水產養殖、海洋環境、造船及海洋休閒管理等領域。高科大的「合併初期行政總部」也曾設立於此（目前高科大實行多校區綜合管理）。
