旗津校區（原高海科大發源地）

• 1946年（創校）： 創立「臺灣省立高雄水產職業學校」，是台灣光復後南部第一所水產職業學校。最初校址即位於高雄市旗津區。

• 1959年： 設立高級部，專注培育漁業與航海人才。

• 1967年： 改制為「臺灣省立高雄海事專科學校」（簡稱高雄海專）。

• 1979年： 改隸為「國立高雄海事專科學校」。

• 校區定位： 旗津校區緊鄰高雄港，是台灣極少數擁有專屬碼頭與訓練船的大學校區。合併後，此校區完全專注於「海事學院」，包含航海、輪機工程等必須實地接觸海洋與船舶的系所，是培養商船幹部與海事人才的重鎮。